氣相色譜質(zhì)譜儀在使用時(shí)，應(yīng)用不同，流動(dòng)相的載體通常是氣體，進(jìn)樣器是尖頭是進(jìn)樣針，那么在通過色譜柱的時(shí)候，由于載氣的分析量較低，所以黏度低流動(dòng)性好。在分析對(duì)象方面質(zhì)量小于1000，沸點(diǎn)低的熱，穩(wěn)定好的化合物。該產(chǎn)品在具體的使用中，由于會(huì)受到樣品的揮發(fā)所帶來的影響，所以一定要注意樣品的一些特點(diǎn)。 
液相色譜儀器在實(shí)驗(yàn)室分析中也就是難以揮發(fā)，或者是穩(wěn)定性差的液體化合物，這樣的一種分析是特殊的，不過在使用檢測器方面通常使用的是熒光檢測器或者紫外檢測器。而這種儀器在具體使用中樣品不管是揮發(fā)或者熱穩(wěn)定性不好都不受限制，在使用的時(shí)候優(yōu)勢(shì)更加明顯，所以如果是對(duì)醫(yī)藥相關(guān)或者是生物相關(guān)的化合物進(jìn)行分析的話，采用這種設(shè)備更好。 

氣相色譜質(zhì)譜儀在具體的分析中，雖然原理差不多。不過，在分離的過程中也非常的成熟，而且在分離分析中不僅效率高，而且速度快，這兩者的分析優(yōu)勢(shì)還是非常的明顯，所以對(duì)于樣品是有機(jī)化合物的話，就能夠采用這種分析儀器，可以起到更好的效果。 
液相色譜儀器在具體的分析中，對(duì)于很難分離的樣品。還是能夠輕松完成的，尤其是在樣品分析中的相互作用能夠在分離的時(shí)候，哪怕是溫度低也能夠輕松地進(jìn)行分析，尤其是樣品回收的方式中，不僅是一種分析方法，而且作為一種程度提取的一種方式，在很多領(lǐng)域都能夠獲得好的效果。由于該方法在很多領(lǐng)域都能夠廣泛使用，所以這種液相色譜儀器應(yīng)用更廣泛。這兩種儀器在具體的使用中還是有很多區(qū)別的，不過在樣品分析的時(shí)候一定要了解樣品的情況，這樣才能夠選擇更合適的儀器進(jìn)行分析。